Sem água de lastro o transporte de mercadorias não seria concebível, porém esta pode causar um enorme problema ecológico a nível mundial. A água de lastro é recolhida no porto de origem para estabilizar o navio porta-contentores que não está na sua total capacidade e é descarregada no porto de destino. Bactérias, plâncton, vírus, pequenos peixes, caranguejos ou medusas são assim transportadas para novos ecossistemas, podendo estas novas espécies causar graves desiquilíbrios ao meio receptor.
Todos os anos são transportadas dez a doze mil toneladas de água de lastro por barco.
A Convenção da Água de Lastro da Convenção da Organização Marítima Internacional (IMO) regula o tratamento obrigatório de água de lastro para navios.
O sistema de gestão da água de lastro (BWM) para navios de grande porte dispõe de inúmeras soluções. Para proteger estas instalações, o tratamento para a maioria dos sistemas é uma filtragem total automática da água recolhida do mar. Assim, o filtro fino é instalado entre o separador de materiais grossos e uma unidade de desinfecção química ou física. Este tem a tarefa de retirar organismos animais e vegetais, bem como sedimentos da água de lastro maiores que 50μm.